Comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour TPE / PME

Nous avons analysé les 30 principaux logiciels de comptabilité conçus pour les TPE et/ou PME. Nous avons sélectionné les 13 meilleurs. Découvrez notre sélection et nos conseils pour choisir votre logiciel.

• Axonaut
• Pennylane
• Indy
• MaCompta
• Zefyr
• Sage Business Cloud
• Itool by EBP
• EBP Compta
• Zoho Invoice
• SumUp
• Wave Soft
• Evoliz

Les 5 meilleurs logiciels de comptabilité pour TPE & PME

Logiciel	Points forts	Découvrir
	Les petites entreprises qui recherchent une solution tout-en-un pour piloter facilement leur entreprise et sa trésorerie.	Découvrir
	Les entreprises et entrepreneurs à la recherche d'un logiciel de gestion comptable tout-en-un, facile d'utilisation et abordable.	Découvrir
	Les indépendant et TPE < 10 salariées pour maîtriser les factures et faciliter l'ensemble de la gestion comptable	Découvrir
	Tous les profils d’entreprises qui souhaitent maîtriser de A à Z toutes les étapes de leur comptabilité, des écritures comptables aux bilans annuels.	Découvrir
	Les entreprises qui souhaitent automatiser leurs processus comptables tout en gardant la main sur leurs télédéclarations fiscales.	Découvrir

#1 Axonaut, la solution de gestion et de comptabilité tout-en-un pour les petites entreprises

Conçu pour les petites et moyennes entreprises, Axonaut est une solution jouant à la fois le rôle d’ERP et celui de CRM. Cet outil complet vous permet d’administrer vos tâches commerciales, comptables et marketing sur une plateforme unique, accessible dans le cloud depuis n’importe quel outil de travail.

Axonaut vous permet d’automatiser la saisie de vos informations comptables et de vos opérations de trésorerie. Il ne vous reste qu’à vérifier les informations enregistrées, à les corriger si besoin, puis à les transmettre d’un simple clic vos données comptables à votre expert-comptable. Notre avis sur Axonaut.

Si ce logiciel de comptabilité vous séduit, il est accessible via un plan tarifaire unique de 49,99 € HT / mois sans engagement pour un seul utilisateur, ou à partir de 34,99 € HT / mois avec un engagement de 2 ans. Chaque utilisateur complémentaire coûte 14,99 € / mois en supplément (dans la limite de 50 utilisateurs). Pour vous faire une idée de ce que peut vous apporter Axonaut dans la gestion quotidienne de votre entreprise, une version d’essai de 15 jours vous est proposée.

#2 Pennylane, le logiciel de gestion tout intégré

Développé par une FinTech Made in France, Pennylane est un logiciel de gestion intégré qui permet de gérer à la fois la facturation, les flux financiers (recettes et dépenses), la trésorerie et les données comptables (bilan, TVA, compte de résultat). Pennylane permet de gérer la comptabilité de A à Z, depuis une interface moderne et facile à prendre en main.

Pennylane est très plébiscité par les TPE et les PME mais s’adresse aussi aux entrepreneurs individuels et aux ETI, grâce à des offres taillées sur mesure en fonction de vos besoins et de la taille de votre entreprise. Signe révélateur, le logiciel est également adopté par de nombreux cabinets comptables français.

Pennylane est disponible à partir de 14 € par mois pour 1 utilisateur (29€ par mois jusqu’à 5 utilisateurs), sans engagement. Le prix des forfaits dépend de deux principaux facteurs : le nombre de fonctionnalités et le nombre d’utilisateurs du logiciel. Il est possible d’obtenir une démo gratuite pour tester le fonctionnement du logiciel. Voir notre Avis sur Pennylane.

#3 Indy le logiciel de comptabilité pour les indépendants

Indy est un logiciel qui répond aux besoins de tous les professionnels indépendants. Il propose 2 versions différentes de son logiciel, l’une est dédiée aux professions libérales et l’autre est pensée pour les entrepreneurs soumis à l’impôt sur les sociétés. Dans les deux cas, Indy s’appuie sur la synchronisation de vos comptes bancaires et sur l’intelligence artificielle pour catégoriser vos dépenses et faciliter le calcul de vos déclarations fiscales.

Vous n’avez qu’à vous connecter régulièrement pour vérifier ce que l’IA d’Indy a catégorisé. Il vous reste à corriger si besoin, et à catégoriser les dépenses et recettes que l’IA n’a pas su classer elle-même. Indy vous permet de calculer automatiquement tous les montants que vous devez déclarer aux impôts et aux différents organismes collecteurs (URSSAF, TVA, Greffe, etc…). Notre avis sur Indy.

Vous pouvez tester Indy gratuitement et sans engagement pendant 15 jours. Indy propose un plan gratuit qui permet aux indépendants de piloter leur activité et de garder un œil sur leurs recettes et leurs dépenses. Si vous souhaitez télédéclarer vos impôts depuis Indy et éditer vos bilans et liasses fiscales, il faut compter 20€ HT /mois pour les professions libérales et microentreprises, et 49€ HT / mois pour les sociétés.

#4 MaCompta, le logiciel de comptabilité pour gérer votre comptabilité de façon autonome

MaCompta est un logiciel créé par des experts comptables pour donner à tous les chefs d’entreprises la possibilité d’internaliser la gestion de leur comptabilité en autonomie ou en collaboration avec leurs experts-comptables.

MaCompta permet la gestion comptable des associations, des indépendants, des artisans et commerçants, des agriculteurs, des SCI et des sociétés commerciales. Vous pouvez gérer la saisie comptable quotidienne, jusqu’à l’édition de vos bilans annuels, en passant par la comptabilité analytique. Notre avis sur MaCompta.

MaCompta est accessible à partir de 6,25 € HT / mois pour la comptabilité simplifiée des associations et micro-entreprises ou 12,42 € / mois pour la gestion courante de la comptabilité des entreprises. À cela s’ajoutent les logiciels complémentaires de liasse fiscale, de facturation, de paie ou de gestion des immobilisations selon vos besoins à partir de 1,67 € HT / mois.

Pour vous convaincre, MaCompta vous propose une version d’essai gratuite pendant 30 jours.

#5 Zefyr, le logiciel de comptabilité entièrement modulable

Zefyr propose un logiciel complet pour la gestion de votre entreprise ou de votre association. Dans le même esprit que MaCompta, Zefyr convient à tous les profils d’entreprises, bien qu’il soit plutôt orienté vers les TPE.

Zefyr est totalement modulable. Vous pouvez opter pour le logiciel de comptabilité seul, que vous reliez à toutes vos autres solutions de gestion (logiciel de paie, CRM, ou gestion commerciale). Mais il est également possible d’y ajouter les autres modules proposés par Zefyr, et ils sont nombreux !

Les tarifs de Zefyr divergent selon votre chiffre d’affaires et le nombre de salariés de votre entreprise. Ainsi, les tarifs démarrent à partir de 10 € HT / mois pour un professionnel indépendant au chiffre d’affaires inférieur à 12 000 euros par an, pour aller jusqu’à 220 € HT / mois pour les entreprises de 19 salariés au chiffre d’affaires supérieur à 100 000 € par an. Notre avis sur Zefyr.

Vous pouvez également tester Zefyr gratuitement et sans engagement pendant 30 jours.

#6 Sage Business Cloud pour les TPE et PME aux exigences variées en matière de comptabilité

Sage est l’un des leaders en matière de logiciels de gestion. Sa solution de comptabilité Sage Business cloud est à la fois robuste et modulable. Différents niveaux fonctionnels permettent aux TPE comme aux PME de trouver toutes les fonctions essentielles à la gestion de leur comptabilité, mais également de leurs pièces commerciales et de l’édition de leurs bulletins de paie.

Sage Business Cloud Compta s’intègre parfaitement à vos autres logiciels de gestion (gestion commerciale, paie, CRM, immobilisations, liasses fiscales, etc…), qu’ils soient développés ou pas par l’éditeur Sage. C’est une solution idéale si vous utilisez plusieurs logiciels différents pour gérer votre entreprise, et si vous externalisez tout ou partie de vos tâches commerciales, comptables ou RH. Notre avis sur Sage Business Cloud.

Sage Business Cloud Comptabilité est accessible dès 30€ HT / mois pour un utilisateur. Vous pouvez ajouter des modules complémentaires comme la paie ou la facturation pour un tarif de 20 € HT / mois. Vous pouvez également ajouter jusqu’à 20 utilisateurs supplémentaires à votre logiciel de comptabilité.

#7 Itool by EBP, le logiciel pour gérer une comptabilité simple

Ce logiciel de comptabilité se veut assez léger, mais néanmoins efficace pour les TPE et les PME aux besoins simples en matière de comptabilité. Le tableau de bord d’Itool est l’un de ses points forts. Il apporte aux petites structures des informations claires et concises sur leurs performances économiques et sur leur trésorerie.

Itool comptabilité propose un accès dédié pour votre expert comptable. Celui-ci peut ainsi vérifier vos écritures, les corriger si besoin et récupérer vos données pour traiter votre bilan annuel. Vous pouvez équiper votre solution comptable Itool d’un module de gestion commerciale, de paie et de liasses fiscales afin d’alimenter automatiquement vos écritures comptables et vos télédéclarations à chaque saisie d’une pièce commerciale ou d’une fiche de paie. Notre avis sur Itool.

Itool comptabilité vous propose gratuitement une version d’essai de 30 jours. Vous pouvez ensuite opter pour l’un des trois différents plans payants disponibles :

• Itool Comptabilité Start, destiné aux indépendants et aux TPE, est accessible dès 12€ / mois,
• Itool Comptabilité Business destiné aux petites PME aux besoins plus complexes est proposé pour 19€ HT / mois,
• Itool Premium est une offre destinée aux grands comptes à la recherche d’une solution comptable sur mesure. Elle est accessible uniquement sur devis.

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#8 EBP Compta, le logiciel de comptabilité pour développer votre entreprise

EBP Compta est un logiciel qui se décline en plusieurs versions adaptées en fonction de votre métier. EBP Propose en effet des logiciels de comptabilité pour les associations, les établissements publics, les TPE et les PME, ainsi que pour les grands comptes. En outre, EBP propose également toute une gamme de logiciels pour la gestion complète de votre entreprise (gestion commerciale, paie, CRM, fiscalité, business plan, etc…).

EBP Compta permet de gérer la comptabilité courante de votre entreprise via une automatisation des saisies. Vous intégrez automatique vos écritures comptables issues d’autres logiciels de gestion ou ERP, même s’il ne s’agit pas de solutions EBP. Vous pouvez ensuite éditer tous vos états comptables et vos télédéclarations, mais également réaliser des prévisionnels de trésorerie, gérer les différents postes de dépenses et vos budgets. Notre avis sur EBP Compta.

EBP Propose 3 plans tarifaires dédiés aux différents profils d’entreprises :

• EBP Compta Hubbix est ainsi dédié aux TPE et coûte 12,50 € / mois,
• EBP Compta Pro est destiné aux PME et est accessible à partir de 47€ / mois (en ligne ou installé sur vos postes de travail),
• enfin pour les besoins avancés EBP Compta Elite est destinée aux grands comptes et son tarif évalué sur mesure et sur devis.

#9 Zoho Invoice, le logiciel de comptabilité gratuit pour gérer vos recettes et vos dépenses

Zoho Invoice est essentiellement une solution de gestion des devis, des factures et des paiements, qui s’intègre parfaitement aux autres outils de la suite Zoho. Il vous permet de suivre vos créances clients et fournisseurs sur une interface sobre et facile à utiliser.

Cette solution est recommandée pour les indépendants et micro-entreprises qui ont une gestion simplifiée de leur comptabilité, mais également aux TPE qui confient la saisie de leurs écritures comptables à un cabinet spécialisé. Notre avis sur Zoho Invoice.

Zoho Invoice est totalement gratuit.

#10 Sumup, logiciel de facturation et de comptabilité pour les commerçants

Sumup, anciennement Debitoor, est une solution de facturation qui permet de gérer vos recettes et vos dépenses. Vous pouvez suivre de près votre trésorerie et vos factures impayées. Sumup permet d’offrir à vos clients la possibilité de consulter et de payer leurs factures en ligne via une plateforme de paiement sécurisée. Ce logiciel s’utilise également sur vos caisses enregistreuses fixes et nomades.

Cette solution orientée vers les commerçants est recommandée pour les entreprises qui confient leurs écritures comptables et leurs déclarations fiscales à un expert comptable. Notre avis sur SumUp.

Sumup est gratuit, seules les factures réglées par cartes bancaires en ligne ou via votre terminal de paiement sont facturées à hauteur de 2,50% sur chaque transaction.

#11 Wave Soft, le logiciel de comptabilité sur-mesure

Parmi les 10 différents modules que propose Wave Soft, on distingue le logiciel de comptabilité. Celui-ci est destiné aux TPE, PME et PMI. Wave Soft permet de traiter la comptabilité de plusieurs établissements, voire de plusieurs sociétés. Il centralise toutes vos tâches comptables et financières, et automatise vos écritures et vos rapprochements bancaires.

Wave Soft vous permet également de suivre vos créances, et d’éditer automatiquement les lettres de relance à destination de vos clients en retard de paiement. Ce logiciel complet est entièrement paramétrable selon vos propres besoins. Notre avis sur Wave Soft.

Wave Soft est disponible uniquement sur devis auprès des revendeurs partenaires. Le tarif dépend essentiellement de l’accompagnement proposé et des paramètres que vous souhaitez mettre en place.

#13 Evoliz le logiciel de comptabilité pour automatiser vos processus administratifs et financiers

Avec Evoliz, vous accédez à un logiciel de gestion complet, doté d’un module de comptabilité où vos écritures comptables se déversent au fil des enregistrements successifs de vos pièces commerciales, et de vos opérations bancaires. Vous n’avez plus besoin de saisir manuellement vos écritures, et de les relier aux opérations bancaires qui leur correspondent. Evoliz le fait pour vous, vous n’avez plus qu’à vérifier et à corriger les journaux qui en ont besoin. Votre expert-comptable peut récupérer vos données en quelques clics et les importer dans le logiciel comptable qu’il utilise dans son cabinet. Notre avis sur Evoliz.

Evoliz propose quatre différents plans tarifaires à destination des TPE comme des PME :

• La formule de base appelée Smoothie Banane coûte 13,50 € / mois et répond aux attentes des indépendants, avec un visu instantané sur leurs dépenses et leurs recettes enregistrées dans le logiciel.
• Ensuite, pour piloter une activité plus dense la formule Banana Split coûte 31,50 € / mois et permet de synchroniser jusqu’à 5 comptes bancaires.
• La formule Banana Combo à 45 € / mois vous permet de gérer vos budgets et de réaliser des prévisionnels de trésorerie.
• Si vous gérez plusieurs sociétés et si vous traiter un grand nombre d’opérations comptables, vous pouvez choisir la formule « Régime de bananes » en demandant un devis préalable.

Tableau de synthèse des 5 meilleurs logiciels de Comptabilité pour TPE et PME

Découvrez aussi notre classement des meilleurs logiciels de comptabilité gratuits pour les TPE et les PME.

5 conseils pour choisir un logiciel de comptabilité pour TPE et PME

#1 Prenez en compte vos compétences en comptabilité

Si vous souhaitez traiter vous-même votre comptabilité, commencez par évaluer vos compétences en la matière. Si vous êtes totalement novice, vous avez tout intérêt à utiliser un logiciel qui automatise les écritures comptables en fonction de vos pièces commerciales. Il faut donc privilégier un logiciel tout en un, qui gère à la fois les factures et les écritures comptables.

#2 Arrêtez-vous sur les fonctionnalités dont vous avez besoin

Votre logiciel de comptabilité doit répondre à vos attentes. Si vous souhaitez gérer une comptabilité simple, basée sur vos recettes et vos dépenses, vous pouvez choisir un logiciel léger. Mais si vous envisagez de piloter votre comptabilité et votre trésorerie en toute autonomie, vous allez vous diriger vers des solutions qui permettent d’éditer votre bilan et de transmettre vos télédéclarations fiscales. Veillez aussi aux modules complémentaires que vous souhaitez relier à votre logiciel de comptabilité (gestion commerciale, CRM pour les relances notamment, gestion des fiches de paie, des immobilisations…).

#3 Réfléchissez à l’évolution de votre entreprise, et de votre logiciel de compta

Vous avez certainement envie de voir votre entreprise prospérer et évoluer ! Tous les logiciels ne sont pas forcément évolutifs. Si vous pensez que le mode de gestion de votre comptabilité risque de changer au rythme des évolutions de votre entreprise, mais que vous ne voulez pas tout de suite une solution comptable complète, il faut veiller à ce que votre logiciel puisse évoluer vers une version supérieure. Si ce n’est pas le cas, il faut au moins pouvoir extraire les données pour les importer vers une autre solution comptable.

#4 Gardez votre budget à l’esprit

Gardez bien en tête le budget que vous vous êtes fixé, afin de ne pas le dépasser et d’envisager tous les logiciels possibles dans cette fourchette de prix.

#5 Demandez conseils à votre expert comptable

Votre expert-comptable est évidemment le mieux placé pour vous conseiller sur la solution la plus adaptée à votre entreprise. Il devra également pouvoir récupérer des données afin, par exemple, d’éditer votre bilan. Il faut donc que le logiciel que vous choisissez soit compatible avec le sien.

Les 3 familles de logiciels comptables

« Logiciel de comptabilité » est un terme générique qui regroupe en réalité plusieurs familles d’outils. Dans l’optique de la sélection de votre logiciel de compta, il est essentiel de bien comprendre comment s’organise le marché. Pour faire simple, il y a trois grandes familles d’outils :

Les logiciels de comptabilité en mode SaaS

Les logiciels SaaS sont conçus pour gérer de manière simple et intuitive sa comptabilité 100% en ligne. Développés par des startups (voire par des cabinets comptables), ils ont pour caractéristique d’être 100% focalisés sur la gestion comptable, d’être accessibles en ligne (pas besoin d’installation), de proposer des interfaces agréables et simples d’utilisation et d’être facturés sur un modèle d’abonnement mensuel / annuel.

Les logiciels SaaS permettent de gérer facilement ses devis et factures, de suivre les encours, de gérer les déclarations de TVA…Ils sont accessibles en mobilité (via smartphone ou tablette) et peuvent se connecter facilement à d’autres applications SaaS. Les logiciels SaaS s’adressent pour l’essentiel aux professions libérales et aux TPE, même si certains logiciels couvrent aussi les besoins des PME. Quelques exemples ? Quickbooks, Sumup, Zoho Invoice, Zefyr ou encore Indy.

Les logiciels de comptabilité avancés

Viennent ensuite les solutions de comptabilité plus complètes, qui proposent des fonctionnalités plus avancées. Cette famille de logiciels permet de gérer l’ensemble de la comptabilité en interne, y compris la production des principaux documents comptables (bilan, compte de résultat, annexes), la gestion des immobilisations, l’envoi des liasses fiscales, la gestion avancée des stocks, de la stratégie financière…Ce sont des logiciels plus complexes à utiliser et plus coûteux à installer. La courbe d’apprentissage est plus importante. Sage Business Cloud Compta est un exemple de logiciel appartenant à cette famille.

Les ERP

Les ERP sont des suites proposant plusieurs modules dédiés à chaque aspect de la gestion de l’entreprise : Comptabilité, Logistique, Commercial, CRM, Marketing & Communication, Production, etc. Ils sont plus complexes à mettre en place au sein de l’organisation, mais peuvent être très utiles à partir d’un certain niveau de développement de votre activité afin de faciliter la gestion au niveau global. Les ERP vous permettent de gérer tous les process liés à votre activité depuis une même plateforme. Citons à titre d’exemple EBP ou Wavesoft.

Grosso modo, les logiciels SaaS s’adressent davantage aux professions libérales et TPE. Les solutions plus complètes comme Sage Business Cloud s’adressent davantage aux PME mais peuvent s’adresser aussi aux TPE ayant des besoins plus avancés en gestion comptable (en particulier aux TPE qui souhaitent internaliser entièrement leur comptabilité). Les ERP sont clairement davantage conçus pour les PME et ETI.

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