Logiciel facturation auto-entrepreneur : 15 outils comparés

Un auto-entrepreneur n'a pas les mêmes besoins qu'une PME : peu de factures, souvent pas de TVA à facturer, un chiffre d'affaires encaissé à déclarer à l'Urssaf et des plafonds à surveiller. Ce comparatif réunit 15 logiciels de facturation pour auto-entrepreneur, gratuits ou payants, avec pour chacun ce que contient vraiment l'offre à 0 €, le prix de la première formule payante et la façon dont il gère la facture électronique. Chaque prix a été lu directement chez l'éditeur concerné en octobre 2026.

Le calendrier pèse sur le choix : depuis le 1er septembre 2026, toute micro-entreprise doit pouvoir recevoir des factures électroniques, et dès le 1er septembre 2027 elle devra émettre ses factures à destination d'autres entreprises au format électronique, y compris en franchise en base de TVA. Si vous cherchez un outil pour une société ou une entreprise plus grosse, le comparatif général logiciel facturation couvre tous les statuts.

Quel logiciel choisir selon votre situation de micro-entrepreneur

Le bon outil dépend moins de la liste de fonctions que de trois questions : facturez-vous des entreprises ou des particuliers, voulez-vous payer quelque chose, et souhaitez-vous que le logiciel prépare aussi votre déclaration Urssaf ?

Les 15 logiciels de facturation pour auto-entrepreneur, outil par outil

Chaque fiche indique pour qui l'outil est conçu, ce qui est gratuit, le premier prix payant affiché par l'éditeur et sa position face à la facture électronique. Les prix sont hors taxes sauf mention contraire.

TeamSystem Facture

TeamSystem Facture Site officiel Lire le test

Testé par Joseph Désiré

Outil de facturation du groupe TeamSystem, pensé pour les indépendants et les micro-entreprises, avec une application mobile pour créer un devis, le transformer en facture et l'envoyer depuis le terrain. Il n'existe pas d'offre gratuite permanente : la formule Réception sert à recevoir les factures fournisseurs, et c'est la formule Essentiel qui permet d'émettre devis et factures électroniques.

• Gratuit : 14 jours d'essai, sans carte bancaire ni engagement.

• Prix : Réception 3,90 € HT par mois en annuel (4,90 € en mensuel) ; Essentiel 9,90 € HT par mois en annuel (11,90 € en mensuel), avec 600 factures électroniques B2B par an, devis, paiement en ligne, rapprochement bancaire et recouvrement des impayés ; Premium 19,90 € HT par mois en annuel (23,90 € en mensuel), 1 200 factures par an, relances automatiques et factures récurrentes.

• Bon à savoir : seules les factures électroniques B2B soumises à l'obligation et transmises par la plateforme entrent dans les quotas ; vos factures à des particuliers ne les consomment pas.

Henrri

Henrri Site officiel Lire le test

Logiciel de facturation français dont la formule Pro est gratuite et sans limite de volume : devis, factures, acomptes, suivi des paiements, relances des impayés et export comptable. L'éditeur explique que les abonnés payants financent les utilisateurs gratuits, qui représentent selon lui plus de 80 % des comptes actifs.

• Gratuit : émission et réception des factures électroniques en illimité, inscription à une plateforme agréée partenaire sans frais, mode test de 10 jours avec des documents non officiels.

• Prix : Expert 17 € HT par mois facturé 204 € par an (signature en ligne des devis, synchronisation bancaire) ; Smart 25 € HT par mois facturé 300 € par an.

• Pour qui : l'auto-entrepreneur qui veut un outil complet sans abonnement et n'a pas besoin de la déclaration Urssaf intégrée.

Facture.net

Facture.net Site officiel Voir la fiche

Service gratuit et illimité qui va au-delà de la facture : pipeline commercial, prise de rendez-vous en ligne et mini-site vitrine avec formulaire de demande de devis. L'éditeur revendique plus de 50 000 entreprises utilisatrices chaque mois.

• Gratuit : devis, factures, suivi des encaissements, lien de paiement et facture électronique.

• Facture électronique : Facture.net est une solution compatible ; les factures transitent par la plateforme agréée SUPER PDP.

• Pour qui : l'indépendant qui prend des rendez-vous ou reçoit des demandes de devis en ligne et veut tout centraliser sans payer.

Tiime

Tiime Site officiel Lire le test

Tiime est lui-même plateforme agréée. Son offre Free couvre la facturation d'une micro-entreprise ; les formules payantes ajoutent un compte pro et la préparation comptable.

• Gratuit : factures et devis personnalisables en illimité, acomptes, avoirs, multi-taux de TVA, suivi des paiements et relance, suivi du chiffre d'affaires, sans carte bancaire.

• Prix : Initial 9,99 € HT par mois facturé 119,88 € HT par an (compte pro Tiime requis) ; Smart 17,99 € HT ; Business 24,99 € HT par mois ; 60 jours d'essai sur les offres payantes.

• Mobile : applications iOS et Android.

Indy

Indy Site officiel Lire le test

Testé par Claire Lambert

Indy part de la comptabilité des indépendants et y ajoute devis, factures et compte pro. L'offre Essentiel suffit pour facturer ; les formules payantes servent surtout à automatiser les déclarations.

• Gratuit : devis et factures en illimité, facturation électronique par plateforme agréée, compte pro avec IBAN et carte.

• Prix : Plus 9 € HT par mois (108 € HT pour un an, ou 12 € HT au mois) avec factures récurrentes, relances automatiques, signature électronique des devis et suivi des seuils de TVA et de sortie du régime micro ; Autonomie 15 € HT par mois (180 € HT par an, ou 19 € HT au mois) avec déclarations Urssaf et TVA télétransmises et livre des recettes.

Abby

Abby Site officiel Lire le test

Testé par Claire Lambert

Abby vise directement les micro-entrepreneurs, avec une formule Basique gratuite qui contient déjà le livre des recettes et des achats, une estimation des cotisations Urssaf et des alertes sur les seuils de TVA.

• Gratuit : facturation électronique, devis et factures illimités. L'envoi des factures par e-mail depuis l'outil et la déclaration Urssaf sont réservés à la formule Start.

• Prix : Start affiché à 9 € HT par mois, Pro à 15 € HT, Business à 33 € HT, hors remise saisonnière ; 14 jours offerts pour tester une offre payante.

Qonto

La néobanque Qonto est plateforme agréée et propose un outil de facturation électronique gratuit, que l'éditeur présente comme « encore plus puissant avec un compte pro Qonto ».

• Gratuit : devis et factures personnalisés en illimité, émission et réception des factures électroniques.

• Prix : compte pro à partir de 9 € HT par mois, avec 1 mois d'essai.

Shine

Compte pro en ligne dont toutes les offres incluent un outil de facturation complet et la plateforme agréée Shine, pour recevoir les factures électroniques directement dans l'espace bancaire.

• Gratuit : offre Free à 0 € avec un compte, une carte virtuelle, 3 virements et prélèvements sans frais par mois et la facturation en illimité.

• Prix : Start 11 € HT par mois, Plus 25 € HT par mois ; 30 jours d'essai.

FNAE-Gestion

Logiciel conçu par la Fédération nationale des auto-entrepreneurs, avec une version gratuite qui inclut la déclaration du chiffre d'affaires à l'Urssaf. L'éditeur indique être en cours de certification NF525.

• Gratuit (Origin) : devis et factures illimités, envoi et réception au format facture électronique, déclaration directe à l'Urssaf, livre de recettes et registre des achats. L'accès à la plateforme agréée est réservé aux adhérents de la FNAE.

• Prix : Infinity 9,90 € TTC par mois ou 99 € TTC par an, 15 jours d'essai ; option TVA à 7,50 € TTC par mois.

Solo

Solo Site officiel Voir la fiche

Plateforme de facturation et de gestion du Portail Auto-Entrepreneur, agréée par la DGFiP. Attention au découpage des offres : la formule gratuite Start permet de recevoir des factures électroniques, de faire des devis et de déclarer son chiffre d'affaires, mais pas de créer des factures.

• Gratuit (Start) : plateforme agréée, réception, devis, déclaration Urssaf, livre de recettes et dépenses.

• Prix : Go 12 € HT par mois pour créer des factures, gérer les acomptes et suivre les seuils de chiffre d'affaires et de TVA ; Pro 19,90 € HT par mois avec la gestion de la TVA ; Premium 34,90 € HT par mois avec un conseiller et l'assistance téléphonique.

MonAE

MonAE Site officiel Voir la fiche

Service en ligne dédié aux auto-entrepreneurs depuis 2009, qui calcule les cotisations et tient la comptabilité simplifiée. Un navigateur suffit, rien n'est à installer.

• Gratuit (Basique) : 10 clients, 10 fournisseurs, 50 devis et 2 000 € de facturation sur 12 mois glissants.

• Prix : Premium 4 € HT par mois ou 40 € HT par an, facture électronique jusqu'à 100 documents par mois via la plateforme agréée SuperPDP.

Freebe

Outil pour freelances avec un prix unique par statut : toutes les fonctions sont incluses, du suivi du temps à la déclaration Urssaf pré-remplie, en passant par le livre des recettes généré automatiquement.

• Gratuit : 30 jours offerts, sans carte bancaire.

• Prix : 12,50 € par mois en paiement annuel pour une micro-entreprise, soit 150 € TTC par an.

• Mobile : pas d'application dédiée annoncée, mais une version adaptée au navigateur du téléphone.

Evoliz

Evoliz Site officiel Lire le test

Testé par Camille Deneu

Logiciel plus complet, à réserver à une activité qui grandit ou qui gère des achats, des stocks et des acomptes de situation. Plateforme agréée incluse (Chaintrust by Visma) et double certification NF 203 et NF 525.

• Prix : formule Essentielle 29 € HT par mois, Avancée 49 € HT par mois, 15 jours d'essai, sans offre gratuite.

VosFactures

VosFactures Site officiel Lire le test

Outil en ligne dont la facture électronique est incluse dans toutes les formules, avec une offre gratuite volontairement limitée.

• Gratuit (Micro) : 3 documents par mois.

• Prix : Basique 5 € HT par mois en annuel, soit 60 € HT par an, documents illimités ; 30 jours de test.

Axonaut

Axonaut Site officiel Lire le test

Logiciel de gestion tout-en-un (devis, factures, suivi commercial, compte pro, trésorerie, stock, projets), immatriculé comme plateforme agréée. Pour un micro-entrepreneur en franchise en base, la question est surtout celle du budget : le prix affiché est celui d'un utilisateur, toutes fonctions comprises, et la grille ne dit rien de propre à la franchise en base, un point à vérifier pendant l'essai.

• Prix : 97 € HT par mois sans engagement, 58,20 € HT par mois en payant un an d'avance ; 15 jours d'essai.

Tableau comparatif : offre gratuite, prix de départ et plateforme agréée

Relevé en octobre 2026. Les éditeurs changent souvent leurs grilles et affichent parfois des remises temporaires : le prix retenu ici est le prix hors promotion.

Logiciel de facturation gratuit : ce que couvre réellement l'offre à 0 €

Plusieurs éditeurs n'ont plus de quota sur leur offre gratuite : Henrri, Facture.net, Tiime, Indy et Qonto permettent d'émettre devis et factures sans limite, facture électronique comprise. Chez Qonto, Indy, Shine et Tiime, l'outil s'adosse à une offre de compte pro ; chez Henrri, ce sont les formules Expert et Smart, choisies par une minorité d'utilisateurs, qui financent la version gratuite.

D'autres offres gratuites ont une limite qui compte pour un auto-entrepreneur :

• Un plafond de volume : 2 000 € facturés sur 12 mois glissants chez MonAE Basique, 3 documents par mois chez VosFactures Micro.

• Une fonction clé absente : pas de création de factures dans Solo Start, pas d'envoi par e-mail depuis Abby Basique.

• Une condition d'accès : la plateforme agréée de FNAE-Gestion Origin est réservée aux adhérents de la fédération.

• Pas d'offre gratuite du tout : TeamSystem Facture, Freebe, Evoliz et Axonaut se testent pendant 14 à 30 jours, puis sont payants.

Pour un auto-entrepreneur qui émet quelques factures par mois, la solution la moins chère reste une offre gratuite sans quota. Parmi les formules payantes qui permettent d'émettre des factures, MonAE Premium (4 € HT par mois) et VosFactures Basique (5 € HT par mois en annuel) ont les prix d'entrée les plus bas de cette sélection. Si vous facturez peu, l'offre gratuite suffit largement. Un abonnement devient intéressant quand il vous évite une tâche récurrente : la déclaration Urssaf, les relances, ou le rapprochement entre factures et virements. Pour une sélection limitée aux offres sans abonnement, tous statuts confondus, voir aussi le comparatif des logiciels de facturation gratuits.

Est-il obligatoire d'avoir un logiciel de facturation en micro-entreprise ?

Aucun texte n'impose d'acheter un logiciel de facturation. En revanche, l'obligation de facturation électronique impose, pour les échanges entre entreprises, de passer par une plateforme agréée, seul intermédiaire reconnu par l'administration fiscale pour émettre, recevoir et transmettre les factures électroniques. Aucun portail public ne remplace cette plateforme pour vos factures entre entreprises. En pratique, dès le 1er septembre 2027, un fichier Excel ou Word ne suffira plus pour facturer une entreprise française assujettie à la TVA.

Un micro-entrepreneur qui travaille uniquement avec des particuliers continue d'émettre des factures classiques ; l'obligation d'e-reporting vise les entreprises assujetties à la TVA, ce que sont aussi les entreprises en franchise en base, qui sont assujetties mais pas redevables. Le simulateur officiel « Évaluer son obligation de facturation électronique » permet de vérifier votre cas.

Facturer avec un modèle Excel ou Word : jusqu'à quand ?

Une facture faite sur un tableur ou un traitement de texte reste valable aujourd'hui si elle porte toutes les mentions obligatoires et si sa numérotation suit une séquence chronologique et continue, ce qui est la principale source d'erreur à la main. Le service public met d'ailleurs à disposition des modèles de factures à adresser à un client professionnel. La limite est fixée par la réforme : dès le 1er septembre 2027, les factures destinées à des entreprises françaises assujetties à la TVA devront être émises au format électronique et passer par une plateforme agréée, ce qu'un fichier Excel ne sait pas faire. Pour une clientèle de particuliers, le modèle reste utilisable, sans les automatismes d'un logiciel.

Les avantages d'un logiciel face au tableur

• Une numérotation sans trou ni doublon, attribuée automatiquement à chaque facture validée.

• Des mentions toujours présentes, dont la mention de franchise en base, recopiée sur chaque document.

• Un livre des recettes tenu tout seul à partir des encaissements, chez Abby, FNAE-Gestion, MonAE, Freebe ou Solo.

• Des relances et des paiements en ligne qui réduisent les retards, avec un lien de paiement sur la facture.

• Le passage à la facture électronique sans changer d'outil, puisque la réception et l'émission par plateforme agréée sont déjà intégrées.

Facture électronique : ce qui change pour un auto-entrepreneur, même sans TVA

La franchise en base de TVA n'exonère pas de la facture électronique : l'obligation d'émission couvre les opérations entre entreprises établies en France et assujetties à la TVA, « y compris celles bénéficiant de la franchise en base de TVA ». Le logiciel choisi doit donc soit être lui-même une plateforme agréée (PA, anciennement appelée PDP), soit transmettre par une PA partenaire, comme Facture.net ou MonAE, qui passent par SuperPDP.

• Vérifier son rattachement : l'annuaire de la facturation électronique indique, pour chaque entreprise, la plateforme agréée qui reçoit ses factures. Vos clients vous y trouveront.

• Changer de plateforme : c'est possible à tout moment ; la nouvelle PA fait les démarches et l'annuaire est mis à jour dans un délai maximal de 15 jours ouvrables. L'ancienne plateforme continue certains services pendant 1 an.

• Les nouvelles mentions : numéro Siren du client entreprise, adresse de livraison si elle diffère, nature des opérations (biens, services ou les deux) et, le cas échéant, l'option pour le paiement de la TVA d'après les débits.

Le détail des formats, de l'e-reporting et des sanctions est traité dans le comparatif logiciel de facturation électronique.

Les mentions à faire figurer sur une facture d'auto-entrepreneur

Un bon logiciel les remplit à votre place, mais il vaut mieux savoir les contrôler sur la première facture :

• votre nom et prénom suivis de la mention « Entrepreneur individuel » ou « EI », votre adresse et votre numéro Siren ;

• la date d'émission, un numéro unique issu d'une séquence chronologique et continue, et la date de la vente ou de la prestation ;

• l'identité du client, la désignation précise, la quantité, le prix unitaire hors taxes et la somme totale à payer ;

• en franchise en base, la mention « TVA non applicable - article 293 B du CGI » sur chaque facture : son absence expose à un redressement en cas de contrôle ;

• la date de règlement, le taux des pénalités de retard et, pour un client professionnel, l'indemnité forfaitaire de 40 € pour frais de recouvrement ;

• pour certains biens vendus à un particulier, la garantie légale de conformité d'au moins 2 ans.

Le numéro de TVA intracommunautaire n'est pas exigé pour une facture d'un montant total hors taxes inférieur ou égal à 150 €.

Prix, conformité, support, évolution : bien faire son choix en micro-entreprise

• Le prix réel : comparez la formule qui contient ce dont vous avez besoin, pas le prix d'appel. Chez Solo, créer des factures demande la formule Go ; chez Abby, envoyer la facture par e-mail depuis l'outil demande la formule Start.

• La conformité : l'outil est-il plateforme agréée, ou relié à une plateforme partenaire, pour l'émission comme pour la réception ?

• Le suivi Urssaf et des seuils : livre des recettes, alertes de plafond, déclaration pré-remplie ou télétransmise.

• Le support : l'écart est réel entre une aide par e-mail seulement (Indy Essentiel et Plus) et un conseiller joignable par téléphone (Solo Premium).

• L'évolution : si vous risquez de passer à la TVA ou de quitter le régime micro, vérifiez que l'outil gère les taux de TVA et la déclaration, et que vos données s'exportent.

• La prise en main : profitez des essais (10 jours en mode test chez Henrri, 14 jours chez TeamSystem Facture et Abby, 30 jours chez Freebe) avec une vraie facture type.

Devis et factures : les fonctions à vérifier avant de choisir

Pour faire un devis puis une facture d'auto-entrepreneur sans ressaisie, l'outil doit transformer le devis accepté en facture, gérer une facture d'acompte puis de solde, et garder la trace des avoirs. Viennent ensuite les fonctions qui font gagner du temps : signature en ligne du devis (Henrri Expert, Indy Plus, Abby Pro, Tiime Business), lien de paiement par carte sur la facture, relances automatiques des impayés et factures récurrentes pour les abonnements mensuels. Pour comparer uniquement la partie devis, voir les logiciels de devis.

Chiffre d'affaires, Urssaf et franchise de TVA : ce que le logiciel doit suivre

Le micro-entrepreneur déclare son chiffre d'affaires encaissé chaque mois ou chaque trimestre ; une déclaration oubliée coûte une pénalité de 60,1 €. Un logiciel utile distingue donc le facturé de l'encaissé et surveille deux familles de seuils.

Le projet de seuil unique de franchise à 25 000 € a été abandonné. Indy Plus, Solo Go, Abby (dès l'offre gratuite) et Freebe annoncent un suivi de ces seuils ; FNAE-Gestion, Solo Start, Abby Start, Indy Autonomie et Freebe déclarent ou pré-remplissent le chiffre d'affaires à l'Urssaf. Si vous passez à la TVA, vérifiez que l'outil gère les taux et la déclaration : c'est une option payante chez FNAE-Gestion (7,50 € TTC par mois) et la formule Pro chez Solo.

Livre des recettes, registre des achats et conservation des factures

La comptabilité d'un micro-entrepreneur est allégée mais pas inexistante. Il doit tenir un livre des recettes encaissées, chronologique, avec le montant, l'origine et le mode de règlement de chaque recette, et en faire le total tous les 3 mois. Les commerçants et l'hébergement tiennent aussi un registre des achats. Pour les ventes au détail et les services à des particuliers de moins de 76 € l'unité, l'inscription peut être globale en fin de journée.

Ces registres peuvent être tenus sous format électronique et se conservent 10 ans, comme les pièces justificatives. Abby, FNAE-Gestion, MonAE, Freebe, Solo et Indy Autonomie les génèrent à partir des factures. Enfin, un compte bancaire dédié devient obligatoire quand le chiffre d'affaires dépasse 10 000 € pendant 2 années consécutives : les offres liées à un compte pro (Shine, Qonto, Indy, Tiime) rapprochent alors automatiquement factures et virements. Pour aller plus loin sur la tenue des comptes, voir les logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneur.

Logiciel à télécharger, en ligne ou application mobile ?

Les recherches de « logiciel de facturation auto-entrepreneur gratuit à télécharger » ou « hors ligne » reflètent une habitude ancienne. L'offre pour micro-entrepreneurs est aujourd'hui surtout en ligne : MonAE le dit en toutes lettres, « un navigateur internet suffit ». Pour facturer en déplacement, TeamSystem Facture et Tiime proposent des applications iOS et Android, Freebe une version adaptée au téléphone. Un logiciel installé sur l'ordinateur reste possible, à condition qu'il soit raccordé à une plateforme agréée avant le 1er septembre 2027 pour les factures entre entreprises.

Artisans, freelances, commerçants : quand un outil spécialisé s'impose

Un auto-entrepreneur du bâtiment a besoin de bibliothèques d'ouvrages, de devis par lots et de factures de situation que les outils généralistes gèrent mal : le comparatif des logiciels de facturation pour artisan leur est dédié. Un freelance qui facture au temps passé gagnera à choisir un outil avec suivi du temps, comme Freebe. Un commerçant qui vend surtout à des particuliers regardera d'abord l'encaissement par carte : Henrri propose un paiement par QR code ou lien et un terminal sur smartphone à 1,2 % + 0,15 € par transaction, Shine et Qonto relient la facture au compte pro. Pour choisir le compte lui-même, voir les comptes pro pour auto-entrepreneur.

Changer de logiciel de facturation sans perdre l'historique

Avant de vous engager, regardez la sortie autant que l'entrée. MonAE permet d'exporter toutes vos données en Excel, CSV ou JSON, Henrri d'exporter factures et documents pour repartir ailleurs, et Freebe d'importer en CSV clients, fournisseurs et anciennes factures. Côté facture électronique, le changement de plateforme agréée est encadré : c'est la nouvelle plateforme qui fait la démarche, et la réception de vos factures reste assurée pendant la transition. Gardez enfin vos anciennes factures et registres 10 ans, même si vous quittez l'outil qui les a produits.