Logiciel comptabilité auto entrepreneur : livre des recettes, factures et Urssaf
Vous êtes auto-entrepreneur et cherchez un outil pour gérer efficacement votre comptabilité ? Les logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneurs sont essentiels pour suivre vos revenus, vos dépenses et vos obligations fiscales. Mais avec tant d'options disponibles, il peut être difficile de choisir le bon. Quel est le meilleur outil de comptabilité pour auto-entrepreneurs ? Et quel est le meilleur outil gratuit ? Consultez la liste ci-dessous des meilleurs outils de comptabilité pour auto-entrepreneurs, gratuits et payants, pour vous aider à faire le bon choix.
Un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur n’a pas le même travail qu’un logiciel de comptabilité d’entreprise. En micro-entreprise, la loi demande une comptabilité allégée, c’est-à-dire un livre des recettes encaissées, un registre des achats selon votre activité, des factures conformes et une déclaration de chiffre d’affaires à l’Urssaf tous les mois ou tous les 3 mois. Le bon outil est donc à la fois un logiciel de comptabilité et un logiciel de gestion : il fait vos devis et vos factures, relance les clients en retard, suit vos dépenses, tient les registres à votre place et vous prévient avant que vous ne dépassiez un seuil.
Ce comparatif présente 13 logiciels qui couvrent tout ou partie de ce travail, avec leurs offres gratuites et leurs prix publics hors promotion, relevés en octobre 2026 sur les sites des éditeurs. Il commence par ce que la loi exige d’un micro-entrepreneur, parce que c’est ce qui permet de juger un outil.
Comptabilité d’un auto-entrepreneur : ce qui est obligatoire, et ce que le logiciel doit produire
Le régime de la micro-entreprise permet de « tenir une comptabilité allégée ». Concrètement, faire la comptabilité d’un auto-entrepreneur revient à tenir à jour deux documents, à conserver les justificatifs et à déclarer son chiffre d’affaires. Un logiciel de comptabilité auto-entrepreneur sérieux produit ces documents automatiquement à partir de vos factures et de votre compte bancaire.
Le livre des recettes encaissées
Tout micro-entrepreneur, quelle que soit son activité, doit tenir un livre des recettes encaissées. Chaque recette y est inscrite dans l’ordre chronologique avec son montant, son origine (l’identité du client), le mode de règlement (chèque, espèces, virement…) et, pour les commerçants et les loueurs en hébergement, la référence de la pièce justificative, par exemple le numéro de la facture. Le total des recettes se fait tous les 3 mois. Pour les ventes au détail et les services rendus à des particuliers dont le montant unitaire est inférieur à 76 €, l’inscription peut être globale en fin de journée.
Le livre enregistre les sommes encaissées, pas les factures émises : une facture de décembre payée en janvier s’inscrit en janvier. C’est pourquoi un logiciel relié à votre compte bancaire est plus fiable qu’un simple outil de facturation pour tenir ce livre.
Le registre des achats, selon votre activité
Le registre des achats n’est pas demandé à tout le monde. Il est obligatoire pour les commerçants et les fournisseurs de prestations d’hébergement : il récapitule, année par année et dans l’ordre chronologique, le détail des achats faits pour l’activité, avec le mode de paiement et la référence des pièces justificatives. Pour une activité libérale, il devient obligatoire si vous bénéficiez de la franchise en base de TVA : un registre annuel du détail des achats de biens et de services, en plus d’un livre journal des recettes. Un logiciel qui catégorise vos dépenses bancaires et y rattache les factures d’achat le remplit sans ressaisie.
Écritures non modifiables, conservation et justificatifs
Une fois enregistrées, les écritures ne peuvent pas être modifiées : une erreur se corrige par une nouvelle ligne, pas en effaçant l’ancienne. Le livre des recettes et le registre des achats peuvent être tenus sous format électronique et doivent être conservés 10 ans à partir de la clôture de l’exercice, comme les pièces justificatives. L’administration fiscale dispense les auto-entrepreneurs de fournir un fichier des écritures comptables (FEC) lorsqu’ils tiennent leur comptabilité sur informatique : un logiciel de micro-entreprise n’a pas à produire de FEC, contrairement à un logiciel de comptabilité de société.
Compte bancaire et déclaration de chiffre d’affaires
Un compte bancaire professionnel n’est pas obligatoire au départ, votre compte personnel suffit. Il devient obligatoire d’ouvrir un compte dédié à l’activité si votre chiffre d’affaires annuel dépasse 10 000 € durant 2 années consécutives. Pour choisir ce compte, consultez le comparatif compte pro auto-entrepreneur. Le chiffre d’affaires se déclare à l’Urssaf tous les mois ou tous les 3 mois, selon votre choix au démarrage ; une déclaration oubliée entraîne une pénalité de 60,1 € par déclaration manquante. Plusieurs logiciels de cette sélection préparent ou transmettent cette déclaration.
Franchise en base de TVA : la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI » et les seuils à suivre
La plupart des micro-entrepreneurs démarrent en franchise en base de TVA : ils facturent hors taxe, sans TVA. Chaque facture doit alors porter la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI », faute de quoi l’entreprise s’expose à un redressement en cas de contrôle. Un logiciel adapté ajoute cette mention automatiquement tant que vous êtes en franchise, puis bascule vos factures avec TVA le jour où vous la perdez. Le mot franchise désigne ici un régime fiscal, à ne pas confondre avec l’adhésion à un réseau de franchise commerciale.
Les seuils de la franchise en base de TVA restent inchangés en 2026 :
Vente de marchandises et hébergement : 85 000 € de chiffre d’affaires l’année précédente, avec un seuil de tolérance de 93 500 € pour l’année en cours.
Prestations de services : 37 500 € l’année précédente, avec un seuil de tolérance de 41 250 € pour l’année en cours.
Au-delà du seuil de tolérance, la TVA s’applique dès le 1er jour de dépassement. Les seuils du régime micro-fiscal sont distincts : pour les revenus perçus en 2026, 203 100 € pour la vente de marchandises et 83 600 € pour les prestations de services et les activités libérales. Ces écarts expliquent l’intérêt des alertes de seuils proposées par Indy, Abby, Solo, Tiime ou Freebe : un micro-entrepreneur peut devoir facturer la TVA tout en restant au régime micro.
Facture électronique : réception depuis le 1er septembre 2026, émission au 1er septembre 2027
Depuis le 1er septembre 2026, toutes les entreprises, quelle que soit leur taille, doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques. À compter du 1er septembre 2027, les micro-entreprises devront aussi émettre leurs factures sous format électronique et transmettre certaines données à l’administration (e-reporting). Les factures entre entreprises françaises passent par une plateforme agréée : votre logiciel de facturation ou de comptabilité doit donc être relié à l’une d’elles. Les nouvelles mentions obligatoires liées à la réforme (dont le numéro Siren du client professionnel) s’appliqueront aux micro-entreprises à la même date de 2027.
Indy, Abby, Tiime, Solo, Pennylane, Henrri, Facture.net, Evoliz et TeamSystem Facture annoncent une facturation électronique conforme dans leurs offres, y compris gratuites pour Indy, Abby, Tiime, Solo (réception), Pennylane, Henrri et Facture.net. La facture électronique ne remplace pas le livre des recettes : elle concerne l’échange des factures, pas la tenue de vos registres.
Logiciel anti-fraude et logiciel de caisse : un auto-entrepreneur en franchise n’y est pas soumis
L’obligation d’utiliser un logiciel ou un système de caisse sécurisé (souvent appelé logiciel anti-fraude ou logiciel certifié) vise les assujettis à la TVA qui enregistrent les paiements de clients particuliers. L’article 286 du CGI en exclut expressément les assujettis bénéficiant de la franchise en base de l’article 293 B. Un auto-entrepreneur en franchise n’a donc pas à acheter un logiciel certifié pour sa caisse ; s’il passe à la TVA et encaisse des particuliers avec un logiciel de caisse, la question se pose à nouveau. Evoliz met en avant une double certification anti-fraude (NF 203 et NF 525), utile dans ce second cas.
Pourquoi un logiciel plutôt qu’un tableur : les fonctionnalités essentielles en micro-entreprise
Un tableur suffit pour tenir un livre des recettes quand on émet quelques factures par mois. Un logiciel devient utile dès que les factures, les encaissements et les achats se multiplient, parce qu’il relie ces trois flux et en tire les registres sans ressaisie. Avant de comparer les prix, vérifiez qu’il sait faire l’essentiel :
Des devis et des factures conformes, numérotés automatiquement, avec la mention de l’article 293 B tant que vous êtes en franchise de TVA.
Un livre des recettes généré à partir des encaissements, et non des factures émises, et un registre des achats si votre activité l’exige.
Une connexion bancaire qui rapproche chaque paiement de sa facture et classe les dépenses.
Le raccordement à une plateforme agréée pour recevoir, puis émettre, les factures électroniques.
Le suivi des seuils de TVA et du régime micro, avec une alerte avant le dépassement.
L’aide à la déclaration Urssaf : calcul du chiffre d’affaires à déclarer, voire transmission directe.
L’export de vos données (registres, factures) pour pouvoir changer d’outil ou les remettre à un comptable.
Les avantages au quotidien : le temps rendu à l’activité
Le bénéfice d’un logiciel se mesure surtout en tâches qui disparaissent : plus de recopie des encaissements dans le livre des recettes, plus de recherche du justificatif d’une dépense au moment de déclarer, plus de calcul manuel du chiffre d’affaires à reporter sur le site de l’Urssaf. Les rappels d’échéances évitent les déclarations oubliées, et le suivi des seuils prévient avant de basculer dans la TVA. Pour un indépendant qui facture lui-même, c’est autant de temps libéré pour les clients.
Logiciels de comptabilité et de gestion pour auto-entrepreneur, outil par outil
Les outils sont regroupés selon ce qu’ils couvrent : d’abord ceux qui tiennent les registres et préparent la déclaration Urssaf, puis les outils de facturation gratuits, enfin les suites de gestion plus complètes.
Indy : comptabilité et déclarations Urssaf automatisées
Indy propose trois offres pour l’auto-entreprise. Essentiel, à 0 €, couvre devis et factures en illimité, la facturation électronique (plateforme agréée), la catégorisation automatique des transactions et un compte pro avec IBAN et carte. Plus, à 9 € HT par mois (108 € HT par an, ou 12 € HT au mois), ajoute les relances automatiques des impayés, la signature électronique des devis et le suivi des seuils de TVA et de sortie du régime micro. Autonomie, à 15 € HT par mois (180 € HT par an, ou 19 € HT au mois), automatise les déclarations Urssaf, TVA, CFE et DAS2, aide à la déclaration de revenus et génère le livre des recettes. Indy propose aussi l’encaissement sur téléphone (Tap to Pay, iOS et Android) avec son compte pro. C’est l’outil le plus complet si vous voulez déléguer la déclaration Urssaf au logiciel.
Abby : facturation, livre des recettes et achats dès l’offre gratuite
Abby inclut dans son offre Basique à 0 € la facturation électronique (Abby est plateforme agréée), les devis et factures illimités, le livre des recettes et achats, l’estimation des cotisations Urssaf et les alertes de seuils de TVA. Les abonnements payants commencent à 9 € par mois et ajoutent notamment le paiement par carte, la déclaration Urssaf, puis les relances d’impayés et la connexion bancaire. Une application mobile iOS et Android complète l’outil. Abby convient bien à un auto-entrepreneur en prestations de services qui veut un livre des recettes et des achats sans payer.
Solo (Portail Auto-Entrepreneur) : registres et déclaration Urssaf dans l’offre gratuite
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Solo est la plateforme de gestion du Portail Auto-Entrepreneur, conçue pour les auto-entrepreneurs. L’offre Start, gratuite, comprend la plateforme agréée, la réception des factures électroniques, la création de devis, la déclaration du chiffre d’affaires à l’Urssaf et le livre de recettes et dépenses. La création de factures commence avec l’offre Go à 12 € HT par mois, qui ajoute aussi le paiement en ligne, le suivi des seuils de chiffre d’affaires et de TVA et la connexion bancaire. Pro, à 19,90 € HT par mois, gère la TVA ; Premium, à 34,90 € HT par mois, ajoute l’assistance par téléphone avec un conseiller.
Tiime : livre de recettes et registres gratuits, compte pro dans les offres payantes
Tiime propose une offre Free pour la micro-entreprise : facturation électronique (plateforme agréée), devis et factures illimités, livre de recettes et registres, suivi du chiffre d’affaires et des paiements avec relance. L’offre Initial, à 9,99 € HT par mois (119,88 € HT facturés à l’année), exige l’ouverture du compte pro Tiime et ajoute le suivi des seuils de TVA et de micro, le rapprochement des transactions et la trésorerie en temps réel ; le calcul et la déclaration Urssaf y sont annoncés comme à venir. Smart, à 17,99 € HT par mois, ajoute la synchronisation bancaire illimitée, les notes de frais et l’archivage des justificatifs à valeur probante.
Freebe : un prix unique avec toutes les fonctions
Freebe facture un seul abonnement par statut, toutes fonctions incluses : pour une micro-entreprise, 150 € TTC par an (12,50 € par mois), après 30 jours d’essai sans carte bancaire. L’outil tient le livre des recettes et le registre des achats à partir des encaissements et des dépenses, prépare la déclaration Urssaf, se synchronise avec plus de 450 banques et intègre le suivi du temps passé par mission. Il vise surtout les freelances qui facturent au temps.
MaCompta.fr : une comptabilité simplifiée qui suit le passage au réel
MaCompta.fr vend ses modules séparément. La comptabilité Simplifiée, destinée aux auto-entrepreneurs, coûte 8,00 € HT par mois (7,04 € HT en formule annuelle) avec connexion bancaire et imputations automatiques ; le module Facturation coûte 8,80 € HT par mois (7,74 € HT à l’année) avec devis, factures illimités et relances d’impayés. Son argument pour la micro-entreprise : en cas de dépassement des seuils, le passage au régime réel et à la TVA se fait sans changer de logiciel ni perdre l’historique.
Pennylane : une offre gratuite pour la micro-entreprise sans TVA
Pennylane affiche une grille dédiée à la micro-entreprise sans TVA. Free, à 0 €, permet d’émettre et de recevoir les factures en conformité avec la facturation électronique, avec application mobile. Starter, à 7 € HT par mois, exige l’activation du compte pro Pennylane et ajoute la synchronisation bancaire et le rapprochement des transactions. Basique coûte 14 € HT par mois ; Essentiel, à 24 € HT par mois, ajoute les relances automatisées, la signature des devis, les notes de frais et le prévisionnel de trésorerie. Chaque plan inclut jusqu’à 1200 factures par an et 15 jours d’essai.
Henrri : la facturation gratuite et illimitée, sans registres
Henrri est un logiciel de facturation gratuit et illimité : devis, factures, avoirs, suivi des paiements et relances automatiques des clients, export comptable et rapprochement bancaire, avec l’émission et la réception des factures électroniques incluses gratuitement. Sa présentation ne mentionne ni livre des recettes ni déclaration Urssaf : c’est la principale différence avec Abby, qui les inclut. Henrri convient si vous tenez vos registres ailleurs ou sur le modèle proposé plus bas.
Facture.net : facturation et suivi clients gratuits
Facture.net est gratuit et illimité : devis, factures, paiement en ligne, suivi des encaissements avec relance en un clic, facturation électronique (réception, émission, e-reporting) et un CRM avec pipelines, opportunités et prise de rendez-vous. C’est l’outil gratuit le plus orienté gestion commerciale de cette sélection. Comme Henrri, il ne présente pas de livre des recettes : prévoyez un export de vos encaissements vers votre registre.
Sinao : devis et factures gratuits, comptabilité en offre Standard
Sinao propose une offre Free à 0 €, limitée à 5 factures de ventes et 5 factures d’achats par mois pour 1 utilisateur. L’offre Standard, à 25 € HT par mois en facturation annuelle (30 € HT au mois), lève ces limites et inclut 3 utilisateurs ; le détail des fonctions de Sinao mentionne un export du livre de recettes et du registre des achats. Pour un micro-entrepreneur qui facture peu, Free peut suffire ; au-delà, le prix de Standard est élevé par rapport aux outils spécialisés.
Evoliz : facturation, achats et relances pour la micro qui grandit
Evoliz démarre à 29 € HT par mois (290 € HT par an) avec la formule Essentielle : factures et devis illimités, signature électronique, traitement des factures d’achat, synchronisation bancaire et exports comptables, plateforme agréée incluse. La formule Avancée, à 49 € HT par mois, ajoute les relances automatiques et la facturation récurrente. Evoliz s’adresse davantage à une micro-entreprise qui prépare un passage en société qu’à un démarrage.
TeamSystem Facture (ex-Comptalib) : la réception seule à petit prix
TeamSystem Facture regroupe désormais l’offre de Comptalib. Son plan Réception coûte 4,90 € HT par mois (3,90 € HT en paiement annuel) pour recevoir les factures électroniques des fournisseurs. Le plan Essentiel, à 11,90 € HT par mois (9,90 € HT à l’année), ajoute l’émission des factures électroniques, les devis, la connexion et le rapprochement bancaires et le recouvrement des impayés, dans la limite de 600 factures par an en formule annuelle. Premium coûte 23,90 € HT par mois (19,90 € HT à l’année). Chaque plan s’essaie 14 jours. Sellsy, qui fait partie du même groupe, oriente d’ailleurs les indépendants vers TeamSystem Facture : son offre Vente & Facturation, vendue à partir de 2 utilisateurs, vise plutôt les équipes commerciales.
Axonaut : un CRM et une gestion complète, à un prix de TPE
Axonaut réunit devis, factures, relances automatiques des devis et des impayés, CRM, commandes, compte pro et trésorerie dans un seul abonnement. Le tarif pour un utilisateur est de 97 € HT par mois sans engagement, et descend à 58,20 € HT par mois avec un engagement d’un an, ou 38,80 € HT par mois sur 3 ans. C’est surdimensionné pour la plupart des auto-entrepreneurs, mais pertinent si le suivi commercial et la prospection pèsent plus que la comptabilité.
Tableau comparatif : offre gratuite, premier prix et registres tenus
| Logiciel | Offre gratuite | Premier prix payant (HT) | Livre des recettes / registre des achats | Déclaration Urssaf |
|---|---|---|---|---|
| Indy | Oui (Essentiel) | 9 € par mois à l’année, 12 € au mois | Livre des recettes dans Autonomie (15 €) | Automatisée dans Autonomie |
| Abby | Oui (Basique) | À partir de 9 € par mois | Oui, dès l’offre gratuite | Dans les offres payantes |
| Solo | Oui (Start, sans création de factures) | 12 € par mois | Livre de recettes et dépenses, dès Start | Oui, dès Start |
| Tiime | Oui (Free) | 9,99 € par mois, compte pro Tiime requis | Oui, dès l’offre gratuite | Annoncée « bientôt » |
| Freebe | Non (essai de 30 jours) | 150 € TTC par an | Oui | Pré-remplie |
| MaCompta.fr | Non (essai d’un mois) | 8,00 € par mois (7,04 € à l’année) | Comptabilité Simplifiée | Non affichée |
| Pennylane | Oui (Free, micro sans TVA) | 7 € par mois, compte pro requis | Non affiché | Non affichée |
| Henrri | Oui, illimitée | Gratuit | Non | Non |
| Facture.net | Oui, illimitée | Gratuit | Non | Non |
| Sinao | Oui (Free, 5 factures de ventes par mois) | 25 € par mois à l’année, 30 € au mois | Export mentionné | Non affichée |
| Evoliz | Non (essai de 15 jours) | 29 € par mois | Non affiché | Non affichée |
| TeamSystem Facture | Non (essai de 14 jours) | 4,90 € par mois (réception seule) | Non affiché | Non affichée |
| Axonaut | Non | 97 € par mois sans engagement | Non affiché | Non affichée |
Prix publics relevés en octobre 2026 sur les pages tarifs des éditeurs, hors promotions temporaires. « Non affiché » signifie que la page tarifs ne mentionne pas la fonction, pas qu’elle n’existe pas : vérifiez auprès de l’éditeur avant de choisir.
Devis, factures, relances et suivi clients : la partie gestion du logiciel
Un logiciel de gestion pour auto-entrepreneur doit couvrir tout le cycle de vente, du devis à l’encaissement. Pour un commerçant indépendant ou une entreprise unipersonnelle qui cherche une solution de gestion complète, c’est souvent cette partie gestion commerciale qui fait gagner le plus de temps, davantage que la comptabilité elle-même.
Du devis à la facture sans ressaisie
Le devis accepté doit pouvoir devenir une facture en un clic, avec les mentions obligatoires et, en franchise, la mention de l’article 293 B. Indy (offre Plus), Pennylane (Essentiel) et Evoliz proposent la signature électronique des devis ; Henrri permet la validation des devis en ligne. Chaque facture doit porter un numéro unique, basé sur une séquence chronologique et continue : gérer ses devis et factures en ligne garantit cette numérotation sans effort.
Relances d’impayés et paiement en ligne
Les relances automatiques sont gratuites chez Henrri et Facture.net, dans l’offre gratuite de Tiime (suivi des paiements et relance), et payantes chez Indy (Plus), Abby (Pro), Pennylane (Essentiel) et Evoliz (Avancée). Le paiement en ligne sur la facture accélère l’encaissement : Abby, Solo, Freebe, Facture.net et Axonaut le proposent. Pour encaisser en face à face, Indy permet d’encaisser un paiement sur mobile avec Tap to Pay.
Fichier clients et suivi commercial
Facture.net et Axonaut intègrent un véritable CRM (pipelines, opportunités, rendez-vous) ; Freebe retrouve automatiquement les coordonnées des clients professionnels à partir de leur nom. Pour la plupart des micro-entreprises, un fichier clients relié aux devis suffit ; un CRM devient utile quand la prospection occupe une part importante de la semaine.
Suivi des dépenses et notes de frais
Le suivi des dépenses d’un auto-entrepreneur sert à tenir le registre des achats et à mesurer ce qui reste réellement du chiffre d’affaires encaissé. Les logiciels reliés à la banque (Indy, Tiime, Freebe, Pennylane, MaCompta.fr) classent les dépenses automatiquement et y rattachent la photo du ticket. Pour les frais avancés pour le compte d’un client et refacturés, voyez le comparatif des logiciels de notes de frais pour auto-entrepreneur.
Application mobile ou logiciel en ligne : où tenir sa compta
Tous les outils de cette sélection fonctionnent dans le navigateur, sans installation, ce qui permet de faire sa compta en ligne depuis n’importe quel ordinateur. Si vous préférez une application installée sur votre Mac, le comparatif logiciel comptabilité Mac présente aussi les applications natives et leur compatibilité avec la puce Apple. Plusieurs proposent aussi une application de comptabilité mobile : Abby et Indy sur Android et iOS, Pennylane dès son offre gratuite. Sur téléphone, les usages utiles sont la photo des justificatifs, la création d’une facture chez le client et le suivi des encaissements ; la déclaration Urssaf et le contrôle des registres restent plus confortables sur ordinateur. Pour une comparaison des outils en ligne destinés aux sociétés et aux indépendants au réel, consultez le comparatif logiciel de comptabilité en ligne.
Gratuit ou payant : ce que les offres gratuites laissent de côté
Un auto-entrepreneur peut tenir sa comptabilité gratuitement : Abby Basique et Tiime Free incluent le livre des recettes, Solo Start le livre de recettes et la déclaration Urssaf, Indy Essentiel la catégorisation bancaire, et Henrri ou Facture.net la facturation illimitée. Ce que les offres gratuites laissent le plus souvent de côté : la synchronisation bancaire complète, les relances automatiques, la déclaration Urssaf transmise par le logiciel et le suivi des seuils. Le premier palier payant se situe entre 7 et 12 € HT par mois chez la plupart des éditeurs. Pour comparer les logiciels gratuits au-delà du statut de micro-entrepreneur, voyez le comparatif logiciel de comptabilité gratuit.
Le modèle de livre des recettes à télécharger
Le service public rappelle que les registres peuvent être tenus sur des livres papier, sur des modèles officiels ou dans un logiciel comptable. Pour un démarrage ou un faible volume, un tableur bien construit suffit. Téléchargez le modèle de livre des recettes (Excel), sans inscription : il totalise le chiffre d’affaires encaissé, le ventile par nature d’activité et signale les lignes auxquelles il manque le mode de règlement. Les seuils ne sont pas préremplis : saisissez ceux de votre activité, relevés sur le site de l’administration.
Comment choisir selon votre activité
Prestations de services ou activité libérale, sans TVA
Un livre des recettes, des factures avec la mention 293 B et la déclaration Urssaf : Abby Basique, Tiime Free ou Solo Start suffisent pour démarrer, Indy Autonomie ou Freebe si vous voulez que le logiciel prépare la déclaration et tienne les registres sans intervention.
Vente de marchandises, artisan ou activité mixte
Le registre des achats devient central et les dépenses sont nombreuses : privilégiez un outil relié à la banque qui rattache les factures d’achat aux transactions (Freebe, Tiime, Indy, MaCompta.fr). Si vous approchez d’un seuil de TVA, vérifiez que l’outil gère la TVA sans changer d’abonnement de façon coûteuse.
Activité qui approche des seuils ou prépare un passage en société
Choisissez un logiciel capable de suivre la sortie du régime micro sans migration : MaCompta.fr conserve l’historique en passant au réel, Indy et Pennylane couvrent aussi les sociétés. Pour une entreprise plus structurée, le comparatif général des logiciels de comptabilité pour TPE et PME présente les outils adaptés à une comptabilité complète.
Changer de logiciel en cours d’activité
Le plus simple est de basculer en début d’année civile ou de trimestre, pour qu’un même outil couvre toute une période de déclaration. Avant de résilier l’ancien abonnement, exportez le livre des recettes, le registre des achats et les factures émises : ces documents restent à conserver même si le logiciel disparaît. Reprenez dans le nouvel outil la numérotation des factures là où elle s’était arrêtée, pour garder une suite chronologique sans trou ni doublon.
Les erreurs à éviter au moment de choisir
Trois pièges reviennent souvent. Confondre facturation et comptabilité : un outil de facturation gratuit comme Henrri ou Facture.net ne tient pas votre livre des recettes. Choisir une offre gratuite sans vérifier ce qu’elle exclut : Solo Start ne crée pas de factures, et les offres Initial de Tiime et Starter de Pennylane exigent l’ouverture de leur compte pro. Enfin, oublier la sortie : vérifiez que vos registres et vos factures s’exportent avant d’y saisir plusieurs années d’activité.
Quand passer par un comptable en ligne
Pour la plupart des micro-entrepreneurs, un logiciel suffit : la comptabilité allégée se limite aux registres, aux justificatifs et à la déclaration de chiffre d’affaires. Un comptable en ligne pour auto-entrepreneur, ou un accompagnement plus ponctuel, se justifie surtout si vous approchez des seuils, si vous hésitez à changer de statut ou si vous cumulez plusieurs activités. À titre de repère, Clementine affiche une offre micro-entreprise à 49 € HT par mois, et l’offre Premium de Solo inclut un conseiller expert. Un logiciel ne remplace pas un conseil fiscal personnalisé ; il remplace la saisie et les rappels d’échéances.
Questions Fréquentes
Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour un auto-entrepreneur ?
Quel est le meilleur logiciel comptable gratuit pour auto-entrepreneur ?
Comment faire la comptabilité d’un auto-entrepreneur ?
Quel est le meilleur logiciel de facturation pour les auto-entrepreneurs ?
Est-il obligatoire d’avoir un logiciel de facturation quand on est auto-entrepreneur ?
Qui est obligé de détenir un logiciel de facturation ?
Un auto-entrepreneur doit-il utiliser un logiciel anti-fraude certifié ?
Quel logiciel de gestion choisir pour suivre devis, factures et clients en micro-entreprise ?
Un logiciel de comptabilité peut-il remplacer un comptable pour un auto-entrepreneur ?
Comment faire une facture quand on est auto-entrepreneur ?
La fiche pratique de l’Urssaf détaille les mentions à porter : votre nom précédé ou suivi de « entrepreneur individuel » ou « EI », votre adresse professionnelle, le nom et l’adresse du client, la date et un numéro de facture qui suit l’ordre chronologique, la désignation, la quantité, le prix unitaire et le total HT, la date d’exécution et la date de règlement, puis, en franchise de TVA, la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI ». Un logiciel de facturation remplit ces champs automatiquement et numérote les factures sans trou.
Est-il obligatoire d’avoir un expert-comptable en tant qu’auto-entrepreneur ?
Non. La comptabilité d’un auto-entrepreneur est allégée : selon l’Urssaf, elle se réduit à la tenue d’un registre des recettes et, selon l’activité, des achats, que l’entrepreneur peut tenir seul ou avec un logiciel. Un expert-comptable ou un comptable en ligne reste un choix, utile pour un conseil sur le statut ou à l’approche des seuils.
Quels sont les différents types de logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneur ?
On en distingue quatre familles : les outils de facturation seule (Henrri, Facture.net), qui ne tiennent pas les registres ; les logiciels de comptabilité simplifiée pour micro-entreprise (Abby, Tiime, Solo, Indy, Freebe), qui produisent le livre des recettes et aident à la déclaration Urssaf ; les logiciels de gestion plus complets (Evoliz, Axonaut), qui ajoutent achats, relances et CRM ; enfin les comptables en ligne, qui combinent un outil et un accompagnement humain.
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