Logiciels de facturation électronique pour anticiper 2026

👉 La vraie question, c’est : êtes-vous équipé pour suivre le mouvement… ou risquer de vous planter dans les règles ?

On a passé en revue les meilleurs logiciels de facturation pour vous faire gagner du temps, éviter les erreurs, et passer au format e-invoicing sans galérer. Pas juste des solutions qui cochent la case “conforme”, mais des outils vraiment pensés pour gérer votre activité.

💡 En plus, vous cherchez un outil qui centralise devis, factures, CRM et relances clients ? Certains tirent clairement leur épingle du jeu — comme Sellsy, qui coche pas mal de cases, notamment côté TPE-PME.

Facturation électronique : de quoi on parle, exactement ?

Non, une facture “électronique” ce n’est pas juste un PDF que vous envoyez par mail. La réglementation qui arrive change la donne.

Pour être légalement conforme, une e-facture devra :

• Être émise, transmise et reçue dans un format structuré (Factur-X, UBL, etc.) ;
• Passer par une plateforme agréée : Portail Public de Facturation (PPF) ou Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) ;
• Contenir les données exigées par l’administration (date, montant HT/TVA, SIRET, etc.) ;
• Garantir l’authenticité, la lisibilité et surtout l’intégrité du document.

👉 Autrement dit : vos fichiers Word, vos PDF maison ou votre tableau Excel ne feront clairement plus l’affaire.

Et ce n’est pas dans dix ans : le calendrier se rapproche. Alors autant choisir un outil adapté dès maintenant, pour éviter le stress de dernière minute.

Comment bien choisir son logiciel de facturation électronique ?

Tous les outils ne se valent pas — surtout avec l’arrivée de la réforme. Avant de vous lancer, posez-vous les bonnes questions. Voici les 5 critères clés à avoir en tête :

Conformité légale 

C’est la base. L’outil doit être 100 % aligné avec la réglementation française (et bientôt européenne), formats structurés inclus.

Simplicité d’usage

Pas besoin d’un bac +5 en compta. Cherchez une interface claire, fluide, rapide à prendre en main, même si vous n’avez jamais fait une facture “normée”.

Fonctions complémentaires

Devis, paiements en ligne, relances automatiques, CRM, exports comptables… Autant d’options qui peuvent vous faire gagner un temps fou au quotidien.

Adaptabilité

Votre activité évolue ? Votre outil doit suivre. Choisissez une solution qui s’adapte à votre taille (indépendant, PME) et à votre contexte (B2B, B2C, international…).

 Intégrations

C’est souvent là que ça coince. Un bon logiciel de facturation doit dialoguer avec vos outils existants : compta, banque, CRM, etc.

💡 Le bon choix, c’est celui qui vous simplifie la vie maintenant, et vous évite des sueurs froides le jour où la réforme devient obligatoire.

Les meilleurs logiciels de facturation électronique (qu’on recommande vraiment)

Avec la réforme qui arrive, tout le monde s’y met. Résultat : une avalanche d’outils qui promettent monts et merveilles… mais tous ne se valent pas.

👉 Ici, des solutions qu’on a testées, qui tiennent la route techniquement et qui sont prêtes pour la réforme. 

Sellsy – L’outil tout-en-un pour gérer factures, clients et ventes

Devis, factures, paiements, relances, factures récurrentes… avec Sellsy, tout est centralisé au même endroit. 

Et surtout, l’outil est déjà prêt pour la facturation électronique obligatoire : formats structurés, portail de dépôt, mentions légales… vous êtes en conformité, sans vous casser la tête.

Ce qu’on aime :

• Génération rapide de devis et factures ;
• Paiements en ligne intégrés (Stripe, GoCardless…) ; 
• Gestion des abonnements et factures récurrentes ultra fluide ;
• Relances automatiques paramétrables ;
• Suivi clair des encaissements (rappels, historiques, tableaux de bord). 

🎯 Pour qui ? Les indépendants, TPE et PME qui veulent une solution robuste, simple à prendre en main, et qui ne veulent pas refaire toute leur stack d’ici 2026.

Indy – L’allié des indépendants… version tout-en-un

Indy s’est taillé une belle réputation auprès des freelances et professions libérales, en particulier les BNC. À la base outil de compta automatisée, Indy propose désormais un module de facturation électronique intégré (Factur-X au programme). L’idée ? Centraliser compta + factures + télédéclarations, sans prise de tête.

Ce qu’on aime :

• L’interface ultra intuitive, pensée pour les non-comptables
• Les modèles de factures pro, conformes et propres
• Le lien direct avec l’Urssaf et les impôts pour les déclarations BNC

🎯 Pour qui ? Les indépendants qui veulent gérer compta et factures sans Excel ni expert-comptable.

Henrri – Le meilleur gratuit pour bien démarrer

C’est souvent le premier réflexe quand on lance son activité : chercher un outil de facturation gratuit… sans se faire avoir. Et Henrri tient plutôt bien la route : conforme à la réglementation, sans pub, sans limite de factures. Bonus : la version e-invoicing est déjà en préparation pour 2026.

Ce qu’on aime :

• L’offre 100 % gratuite (même pour plusieurs clients)
• L’ergonomie très accessible, même pour les allergiques à l’administratif
• Le support client dispo, même en version gratuite

🎯 Pour qui ? Les TPE, freelances ou assos qui veulent commencer proprement sans dépenser un euro.

Sage Business Cloud – Pour les PME qui veulent du lourd (et du solide)

Sage, c’est le mastodonte bien connu des services financiers. Leur offre Cloud s’adresse clairement aux entreprises structurées : gestion des ventes, achats, stocks, compta… tout est là. Côté facturation électronique, la solution est évidemment prête pour 2026 (formats conformes, intégration PDP/PPF, etc.).

Ce qu’on aime :

• Le niveau de paramétrage possible pour les flux complexes ;
• L’écosystème complet (compta, RH, gestion commerciale…) ;
• Les connecteurs avec les cabinets comptables qui bossent déjà sous Sage.

🎯 Pour qui ? Les PME en croissance, avec plusieurs utilisateurs, plusieurs entités, et un besoin de structuration plus poussé.

Tiime – L’option pensée pour les indépendants (et les experts-comptables)

Tiime mise sur la simplicité : tout se fait depuis l’app (ou le web), avec un positionnement clair sur les indépendants, micro-entrepreneurs, professions libérales… Et si vous bossez déjà avec un expert-comptable, bonne nouvelle : ils ont l’habitude de bosser avec.

Ce qu’on aime :

• L’app mobile ultra clean, parfaite pour créer une facture depuis le train
• La connexion bancaire pour faire le rapprochement auto
• L’envoi en e-invoicing déjà prêt

🎯 Pour qui ? Freelances, consultants, professions libérales, et ceux qui ne veulent pas passer 3h à comprendre leur outil de facturation.

Evoliz – Le bon mix entre gestion et compta

Evoliz, c’est un logiciel français qui mise sur l’équilibre : ni trop usine à gaz, ni trop basique. Idéal si vous cherchez une solution sérieuse pour émettre des factures électroniques tout en gardant un lien fluide avec votre compta.

Ce qu’on aime :

• La possibilité d’avoir ses factures, ses achats et sa trésorerie au même endroit
• Les passerelles avec les logiciels comptables (Sage, Cegid, ACD…)
• Les tableaux de bord bien foutus pour suivre sa trésorerie en temps réel

🎯 Pour qui ? Les TPE/PME qui veulent un logiciel de gestion simple et carré, compatible avec leur cabinet comptable.

Axonaut – L’alternative française tout-en-un

Moins connu que Sellsy, mais très pertinent pour les TPE et PME, Axonaut propose un outil bien pensé, avec un positionnement “ERP léger”. Factures, CRM, trésorerie, relances, notes de frais… tout est intégré, sans complexité inutile. Et bien sûr, la facturation électronique conforme est déjà dans les tuyaux.

Ce qu’on aime :

• L’approche 360° qui évite de multiplier les outils ;
• Le rapport qualité-prix très correct ;
• L’ergonomie simple et sans jargon.

🎯 Pour qui ? Les boîtes qui veulent centraliser la gestion sans tomber dans un monstre logiciel.

Zervant – Simplicité maximale pour freelances pressés

Zervant, c’est la solution minimaliste qui fait bien ce qu’on lui demande : créer des devis et des factures en quelques clics, sans se noyer dans les fonctionnalités. Très populaire en Scandinavie, l’outil se met à jour pour répondre aux exigences françaises de 2026.

Ce qu’on aime :

• La prise en main immédiate, zéro friction ;
• Les relances automatiques simples à paramétrer ;
• La version gratuite qui suffit souvent pour démarrer.

🎯 Pour qui ? Les freelances, micro-entrepreneurs ou artisans qui veulent une solution rapide, efficace, sans prise de tête.

Pourquoi Sellsy sort du lot ?

Oui, tous les logiciels permettent d’émettre une facture. Mais avec Sellsy, vous facturez, vous suivez, vous encaissez… et vous pilotez — le tout sans perdre une heure à faire le tri entre dix outils.

Bien facturer, et surtout bien encaisser

Envoyer une facture, c’est bien. Se faire payer, c’est mieux.

Avec Sellsy, tout est pensé pour accélérer le paiement et sécuriser vos flux :

• Factures conformes à la réforme (Factur-X, PDP… prêt pour 2026) ;
• Envoi automatisé, suivi de lecture, relances programmées ;
• Intégration directe avec Stripe, GoCardless, virements… pour encaisser plus vite ;
• Suivi des achats inclus, pour une vision claire de vos dépenses.

Résultat : vous réduisez les retards, vous suivez vos encaissements en temps réel, et vous dormez plus tranquille.

Un outil de facturation… mais aussi de compta

Pas besoin de jongler entre Excel, un outil de facturation, et un export comptable.

Sellsy aligne tout :

• Rapprochement bancaire automatique ; 
• Pré-compta intégrée avec exports simples pour votre expert-comptable ; 
• Reporting clair et utile : CA, relances, impayés, prévisions…

👉 Ce n’est pas juste de la facturation, c’est un outil qui vous aide à piloter votre boîte.

Connecté avec vos outils métiers

Sellsy s’intègre nativement avec les apps que vous utilisez déjà :

• Logiciels comptables (Pennylane, Cegid, etc.) ;
• Services bancaires ;
• Signature électronique ;
• Portails de facturation électronique (à venir avec la réforme).

Pas de ressaisie, pas de bricolage. Tout communique, tout est synchronisé.

Plus qu’un outil de facturation, une solution pensée pour scaler

Ce qui fait la différence avec Sellsy, c’est sa capacité à aller bien au-delà de la simple émission de factures. L’outil est conçu pour accompagner la croissance de votre boîte, sans friction.

Par exemple :

• Vous bossez en mode projet ou en régie ? La facturation d’avancement vous permet de facturer à chaque étape clé, au rythme réel du terrain. Idéal pour les agences, les freelances ou les métiers du BTP.
• Vous avez des revenus récurrents ? Sellsy gère les abonnements et génère automatiquement les factures associées. Fini les oublis, fini les copier-coller.
• Vous en avez marre de courir après les paiements ? Entre les relances automatiques, la balance âgée claire et les pages de paiement en ligne, tout est pensé pour vous aider à encaisser plus vite — et mieux suivre vos flux.
• Et côté commercial, le catalogue produit, la transformation instantanée de devis en facture, ou encore la connexion à l’annuaire SIRENE permettent de structurer vos offres et vos contacts en quelques clics.

👉 En bref, vous facturez mieux, vous facturez plus vite, et vous reprenez le contrôle sur vos encaissements.

Et maintenant, Sellsy passe à l’IA

Nouveauté notable : Sellsy IA, qui intègre l’intelligence artificielle au cœur du logiciel.
Ce que ça change pour vous ?

• Résumés de fiches clients générés automatiquement ;
• Aide à la rédaction d’emails plus pertinents (et plus rapides) ;
• Génération de modèles adaptés à vos cibles.

Bref, un assistant virtuel intégré, pour aller plus vite, mieux communiquer, et ne rien laisser passer.

Bonus : intégration native avec l’annuaire SIRENE

Autre détail (très) utile : l’intégration avec la base SIRENE vous permet d’enrichir automatiquement vos fiches clients avec les infos légales à jour (raison sociale, SIRET, données financières…). Moins de saisie, moins d’erreurs, plus de fiabilité.

Conclusion : la réforme approche, pas le moment d’improviser

D’ici 2026, finies les factures à l’ancienne. Et non, ce n’est pas un truc d’expert-comptable : ça concerne toutes les boîtes.

👉 Ce qu’il vous faut ? Un outil simple, conforme, capable de gérer vos devis, factures, paiements, relances… et qui s’intègre sans friction à votre quotidien.

On l’a vu :

• Certains outils font le job pour démarrer proprement (Henrri, Indy, Tiime) ;
• D’autres vont plus loin, avec une vraie logique de gestion (Evoliz, Axonaut…) ;
• Et Sellsy tire son épingle du jeu pour ceux qui veulent centraliser la facturation, le suivi client et le pilotage de l’activité, le tout sans usine à gaz.

Le vrai enjeu, ce n’est pas juste de se mettre en règle. C’est de gagner du temps, d’éviter les erreurs… et de poser les bases d’une gestion plus fluide.

Vous avez encore un peu de temps pour vous équiper. Mais clairement, c’est maintenant que ça se joue.